Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms