Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clvs1Q9D4C9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms