Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933421I07RikQ9D420 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms