Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag1Q9D3E6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag1Q9D3E6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms