Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy3Q9D394 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms