Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms