Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc8Q9D2H8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms