Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc6bQ9D289 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms