Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X9

Tmem50b, Transmembrane protein 50B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50bQ9D1X9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50bQ9D1X9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50bQ9D1X9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms