Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms