Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TbcbQ9D1E6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TbcbQ9D1E6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TbcbQ9D1E6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms