Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca7Q9D0M2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms