Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbed3Q9D0L1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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