Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shmt2Q9CZN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms