Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc77Q9CZH8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms