Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB0

Sdhc, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhcQ9CZB0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SdhcQ9CZB0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SdhcQ9CZB0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SdhcQ9CZB0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SdhcQ9CZB0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SdhcQ9CZB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SdhcQ9CZB0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SdhcQ9CZB0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SdhcQ9CZB0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms