Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bud23Q9CY21 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms