Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx7Q9CY18 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx7Q9CY18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms