Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms