Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms