Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms