Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd4Q9CWX4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms