Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx28Q9CWT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx28Q9CWT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms