Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnbl1Q9CWL8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms