Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms