Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Filip1Q9CS72 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Filip1Q9CS72 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Filip1Q9CS72 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms