Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem42Q9CR22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms