Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms