Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmd9Q9CR00 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmd9Q9CR00 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmd9Q9CR00 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmd9Q9CR00 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd9Q9CR00 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd9Q9CR00 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms