Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms