Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTRAFQ9CQE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms