Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med4Q9CQA5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms