Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp2Q9CQ73 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms