Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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