Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg3Q9CPX6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms