Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11bQ99PV8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms