Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acsbg1Q99PU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Acsbg1Q99PU5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsbg1Q99PU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms