Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.7 ms