Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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