Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rims1Q99NE5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms