Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms