Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcgf6Q99NA9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms