Protein–RNA interactions for Protein: Q99N16

Cyp4f3, Leukotriene-B(4) omega-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f3Q99N16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f3Q99N16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp4f3Q99N16 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms