Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BrapQ99MP8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms