Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja3Q99M87 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja3Q99M87 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja3Q99M87 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnaja3Q99M87 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms