Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms