Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf19Q99KP6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf19Q99KP6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms