Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms