Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms