Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms